Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps33bP59016 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps33bP59016 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps33bP59016 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps33bP59016 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps33bP59016 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps33bP59016 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps33bP59016 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms