Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhbdl3P58873 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms