Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm2P58774 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm2P58774 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm2P58774 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm2P58774 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm2P58774 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms