Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Paxbp1P58501 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms