Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf2P58021 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms