Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms