Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn18P56857 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn18P56857 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn18P56857 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn18P56857 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn18P56857 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms