Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms