Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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