Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pex2P55098 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms