Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms