Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms