Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acod1P54987 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms