Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Faf1P54731 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms