Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms