Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CcnfP51944 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnfP51944 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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