Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApodP51910 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApodP51910 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApodP51910 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms