Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms