Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RoraP51448 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RoraP51448 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RoraP51448 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RoraP51448 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RoraP51448 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RoraP51448 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RoraP51448 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RoraP51448 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RoraP51448 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RoraP51448 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RoraP51448 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RoraP51448 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RoraP51448 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RoraP51448 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RoraP51448 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RoraP51448 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RoraP51448 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RoraP51448 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RoraP51448 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms