Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc13P50207 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms