Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BckdhaP50136 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BckdhaP50136 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms