Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms