Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpreP49446 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PtpreP49446 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PtpreP49446 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PtpreP49446 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PtpreP49446 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpreP49446 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms