Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms