Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms