Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfx2P48379 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms