Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms