Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TgfaP48030 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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