Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CratP47934 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CratP47934 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CratP47934 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CratP47934 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CratP47934 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CratP47934 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CratP47934 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms