Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms