Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gli1P47806 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms