Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo1bP46735 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo1bP46735 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms