Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms