Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
InaP46660 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
InaP46660 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
InaP46660 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
InaP46660 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
InaP46660 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
InaP46660 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
InaP46660 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
InaP46660 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
InaP46660 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
InaP46660 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
InaP46660 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
InaP46660 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
InaP46660 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
InaP46660 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
InaP46660 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
InaP46660 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms