Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11bP46638 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11bP46638 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab11bP46638 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab11bP46638 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab11bP46638 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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