Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx1P43345 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms