Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-2P42586 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms