Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TfamP40630 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TfamP40630 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TfamP40630 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TfamP40630 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TfamP40630 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TfamP40630 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms