Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd9P40240 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms