Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms