Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lig1P37913 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lig1P37913 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms