Protein–RNA interactions for Protein: P37242

Thrb, Thyroid hormone receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThrbP37242 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ThrbP37242 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ThrbP37242 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms