Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sar1aP36536 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms