Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc5P35689 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms