Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfc1P35601 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms