Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab23P35288 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms