Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn11P35235 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms