Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptk2P34152 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms