Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms