Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc10P31257 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms